玛卡原产高海拔山区，适宜在高海拔、低纬度、高昼夜温差、微酸性砂壤、阳光充足的土地中生长；分布于南美安第斯山脉，人工种植于秘鲁中部和南部，中国的云南和新疆等地区，有较大面积的适种土地。
玛卡属于独行菜属植物，在植物形态特征上与其他独行菜属植物有很多共性。独行菜属植物约175种，全世界有广泛分布；为一年至多年生草本或半灌木，常具单毛、腺毛、柱状毛；茎单一或多数，分枝。叶草质至纸质，线状钻形至宽椭圆形，全缘、锯齿缘至羽状深裂，有叶柄，或基部深心形抱茎。总状花序顶生及腋生；萼片长方形或线状披针形，稍凹，基部不成囊状，具白色或红色边缘；花瓣白色，少数带粉红色或微黄色，线形至匙形，比萼片短，有时退化或不存；雄蕊6个，常退化成2或4个，基部间具微小蜜腺；花柱短或不存，柱头头状，有时稍二裂；子房常有2个胚珠。短角果卵形、倒卵形、圆形或椭圆形，扁平，开裂，有窄隔膜，果瓣有龙骨状突起，或上部梢有翅。种子卵形或椭圆形，无翅或有翅；子叶背倚胚根，很少缘倚胚根。
玛卡是一种一年生草本植物。其地下部分的块状根茎，长10至14厘米、直径在最宽部分3至5厘米，周长为15厘米；形似小萝卜，自然界发现有两种类型的颜色，黄色和紫色，质地稠密具有一定硬度。植物的须根呈白色，长达15厘米，在各个方向上大量延伸。叶子的长度为20至23厘米，具齿痕，叶形二回羽状分裂，长8至13厘米，宽3厘米，生长垂向地面。叶柄很结实，可达到的长度超过10厘米，二级茎形成分支，长10到16厘米。
玛卡是独行菜属中**生有肥厚的下胚轴的物种。下胚轴与根融合，形成了一个粗糙倒梨形的块根。玛卡根部的形状和体积差距很大，有三角形、椭圆形或矩形。玛卡的下胚轴可能呈金色或者淡黄色、红色、紫色、蓝色、黑色或者绿色。每一株都被认为是独特的基因品种。特别的性状（主要指根的颜色）会根据其不同营养和治疗特性而被特别的人工选 培育。在秘鲁，淡黄色的根最常见，形状、味道也**。
玛卡的主要食用部位是玛卡根，播种后7-9个月，玛卡植株长到12-20厘米长的时候，可以得到膨大的玛卡根，数月后又可开花，开花后一个半月就可以得到果实。在条件适宜的情况下，玛卡完成一个生活周期只要1年时间，有研究报道在美国加利福尼亚州等地，只要提供充足的水分和选择合适的季节播种，在野外生长的玛卡完全可以在一年内完成生活周期。然而更多时候，当玛卡根长到**直径约5厘米，受限于雨水量，人们将它挖起，晒干，贮藏一段时间，等条件合适时，玛卡根可以再萌发，栽培后4-6个月收获种子，这样玛卡就需要在两年内才能完成一个生活周期因此说玛卡是一年生或两年生植物。
玛卡要生活在海拔三千多米的高原，昼夜温差要大，生长条件比较恶劣。玛卡的生长条件非常苛刻，它只适宜生长在高原山区高寒地带，要求昼夜温差30℃以上、雨量充沛、周围有淡水湖，这种独特的生长条件限制了它的种植。而且由于其对土壤养分极强的“吸收力”，每收获一季，土地需休养七年。玛卡在中国的种植要完全再现安第斯山玛卡的生长环境，气候、温差、土壤等条件也要完全吻合，才能保证玛卡的纯正优良。
